? Obvykle každá molekula DNA uvnitř vašich buněk obsahuje dva prvky spolu spojeny interakcí tzv. vodíkové vazby . Změna podmínek však může “ denaturaci “ DNA a způsobit, že tyto prvky oddělit . Přidání silné báze , jako je NaOH , výrazně zvyšuje hodnotu pH , což znamená snížení koncentrace vodíkových iontů v roztoku a denaturaci dvouvláknové DNA . Vliv pH
hydroxidu koncentrace iontů a pH mají přímý vztah , což znamená, že vyšší pH ,vyššíkoncentrace hydroxidu . Stejně tak , že čím nižší je koncentrace vodíkových iontů padá. Při vysoké hodnotě pH , potom se roztok je bohatá na hydroxidové ionty , a tyto záporně nabité ionty může vytáhnout vodíkové ionty z molekul , jako jsou páry bází v DNA . Tento proces naruší vodíkové vazby , které drží dva řetězce DNA spolu , přimět je, aby oddělení .
RNA vs DNA
Na rozdíl od RNA , DNA postrádá hydroxylové skupiny na pozice 2 “ v každé skupině cukru . Tento rozdíl je DNA mnohem stabilnější v alkalickém roztoku . V RNA ,hydroxylovou skupinu na pozici 2 ‚ může vzdát iont vodíku do roztoku při vysoké hodnotě pH , vytváří vysoce reaktivní alkoxide ionty , které útočí na fosfátovou skupinu drží dvou sousedních nukleotidů dohromady . DNA není trpí touto vadou , a proto má pozoruhodnou stabilitu při vysoké hodnotě pH .
Alkalické lýzy
Molekulární biologové často využívají alkalické denaturace izolovat plazmid DNA z bakterií . Plazmidy jsou malé smyčky DNA oddělují od bakteriálního chromozomu . V alkalické lýzy Miniprep , biologové přidat prací prostředek a hydroxid sodný pro bakterie suspendované v roztoku . Detergent rozpouští bakteriální buněčné membrány , zatímcohydroxid sodný zvyšuje pH a jevysoce alkalický roztok . Vzhledem k tomu, rozbité buňky uvolňují svůj obsah ,DNA uvnitř rozdělí na jednotlivé prameny , nebo denaturuje .
Reannealing
Pobiolog extrahuje DNA z buňky , se přidává další činidla vrátit řešení více neutrálním pH a vysrážení detergent . Změna pH umožňuje plasmidové prvky na reanneal ; objemný chromozom , ale nemůže dělat to samé , takbiolog jej odstranit spolu s pracím prostředkem , denaturované proteiny a jiné rozmanité harampádí , takže plazmid za sebou . Alkalické lýzy není zcela čistí plasmidové DNA ; spíše , že slouží jako“ rychlé a špinavé “ způsob, jak extrahovat z buňky a odstranit většinu jiné nečistoty .